O Caupi adapta-se a diferentes condições edafoclimáticas do Brasil e apresenta importância socioeconômica, caracterizando-se como agricultura de subsistência praticada por agricultores familiares com uso de sementes de cultivos subsequente. Objetiva-se avaliar a divergência genética de acessos de feijão-caupi da região de Pedro Afonso-TO. O trabalho foi desenvolvido em casa de vegetação da área experimental do Campus Avançado Pedro Afonso-TO do Instituto Federal do Tocantins (IFTO). Foi preenchido sacos de mudas de 12L com solo e semeadas três sementes por saco. Procedeu-se a montagem do delineamento experimental em Blocos casualizados com três blocos e dez acessos com duas plantas por acesso. Após a final do ciclo da cultura foram coletadas as vagens com os pedúnculos para aplicação dos descritores em laboratório multidisciplinar do Campus. Após as análises de variância, da diversidade genética baseada na distância de Mahalanobis e do agrupamento pelo método de otimização de Tocher e o método hierárquico UPGMA. Na análise de variância não houve efeito significativo em todos os caracteres utilizados indicando não haver variabilidade genética. Foram formados cinco grupos com a mesma distribuição dos acessos nos dois métodos de agrupamento utilizado no experimento.