Os sistemas agroflorestais é uma das alternativas que visam a produção e ao mesmo tempo propõe uma ação voltada para  recuperação ou até mesmo conservação do meio ambiente, uma vez que se pode produzir e recuperar, compreendendo de que maneira ocorre as relações com o seres vivos e promoção da biodiversidade. Trata-se de uma pesquisa quantitativa e qualitativa, em campo por meio de observação e coleta de 30 amostras mensal da parte da rizosfera das plantas de maneira alternada. Com a utilização de ferramentas como: Prancheta, papel A4, caneta, enxada, enxadeco, máquina fotográfica, aparelho celular e notebook. Diante disso, a presente pesquisa teve por objetivo, compreender a importância da avaliação da presença de fitonemátoides e animais de diferentes filos em um Sistema Agroflorestal, localizado no setor de fruticultura do IFTO-Campus Araguatins. Durante o período analisado nos meses de Junho a  Julho de 2019  não foi observado a presença  nematoides nas raízes coletadas para amostra. Um dos motivos pode ser explicado devido o solo ser bastante rígido e uma vasta presença de folhas secas, levando em consideração que o solo mais propício para proliferação dos mesmos é o solo argiloso, pois retém grande quantidade de água e torna o ambiente propício a estes vermes. Este estudo permitiu que se obter um leque de informações, ao perceber que os organismos podem interagir com indivíduos da mesma espécie ou de espécies distintas, demonstrando qual o papel de cada um no nicho ecológico, aspectos positivos ou negativos, mas necessários para que haja essa relação entre o meio.