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As sementes são insumos importante no sistema produtivo agrícola, em que empresas e produtores buscam qualidade fisiológica superiores. Dentro de um talhão existe heterogeneidade que pode ser identificada com o uso de análises geoestatísticas gerando mapas de distribuição espacial. O trabalho teve como objetivo identificar a distribuição espacial da qualidade fisiológica e do potencial de armazenamento de sementes de soja obtidas em condições de várzea tropical, utilizando a geoestatística. As sementes foram obtidas num campo de sementes de 17 hectares, em Lagoa da Confusão-TO. A amostragem foi sistemática e com malha amostral regular com distância de 100x100 m entre cada ponto. Após a colheita, as plantas foram trilhadas com a sementes sendo limpas, secas e armazenadas até o momento das análises fisiológicas (50, 100, 150 e 200 dias após o armazenamento). Os resultados do teste de tetrazólio, vigor e viabilidade, apresentaram maior precisão com os valores médios tendo pequenas alterações em função do tempo de avaliação com média de 81,98% ±0,58% (Vigor) e 95,30% ±0,35% (Viabilidade). Avaliações feitas após períodos maiores de armazenamento apresentaram maior variabilidade e assim permitiram melhor distinção dos diferentes pontos na área de estudo. Neste trabalho foi possível identificar a variabilidade espacial na área de estudo, identificando regiões com qualidade de sementes boas e ruins. As características relacionadas ao vigor, principalmente o envelhecimento acelerado, permitiram melhor distinção da variação na área de estudo. Da mesma forma, as avaliações feitas após períodos maiores de armazenamento apresentaram maior variabilidade e assim permitiram distinguir melhor os diferentes lotes avaliados.