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As sementes são consideradas insumo importante no sistema produtivo agrícola, em que empresas e produtores buscam sementes com qualidade superior. Com relação ao ambiente, dentro de um talhão existe heterogeneidade que pode ser identificada com o uso de análises geoestatísticas que permitem gerar mapas de distribuição espacial. Desta forma, é possível verificar em quais locais do talhão a qualidade das sementes é menor. Após o exposto, o objetivo do presente trabalho foi identificar a variabilidade espacial da qualidade (avaliada pela composição química) de sementes de soja obtidas em condições de várzea tropical, com o uso da geoestatística. Para tanto, as sementes foram obtidas num campo de sementes de 17 hectares, na região de Lagoa da Confusão-TO. A amostragem foi sistemática e com malha amostral regular com distância de 100x100 m entre cada ponto (1 ponto por hectare). Após a colheita, as plantas foram trilhadas com a sementes sendo limpas, pesadas, secas e armazenadas até o momento das análises químicas de determinação dos teores de óleo e proteína. Os teores de óleo e proteína apresentaram valores médios de 21,82% e 35,79%, respectivamente e com uma variação pequena (CV < 3,22%). No teor de proteína foi possível realizar o ajuste do semivariogramas e gerar o mapa de variabilidade espacial da área de estudo, diferente do teor de óleo em que não houve ajuste. O mapa gerado permitiu identificar regiões com maiores e menores teores de proteína em sementes de soja, no local de estudo.