Visando à introgressão de genes de resistência a Meloidogyne incognita raça 3 no algodão cultivado, um mapa de ligação foi construído, usando uma população F₂, obtida do cruzamento entre o genótipo G. hirsutum FM 966 (suscetível) e o acesso G. barbadense CIR1348 (resistente). Esse mapa foi baseado em marcadores microssatélites. No total, 269 marcadores microssatélites já publicados foram usados. Os 269 pares de primers SSR revelaram 313 locos que segregaram na população de mapeamento. Como em outros mapas genéticos de algodão tetraploide publicados, alguns marcadores amplificaram mais de um loco. O mapa genético construído com a população F₂ consistiu de 29 grupos de ligação. Um comprimento total de 4.294 cM foi obtido e os grupos variaram de 52,8 cM (com 3 marcadores) a 241,3 cM (14 marcadores) com uma distância média de 15 cM entre marcadores adjacentes. Esse mapa foi utilizado para identificação de QTLs ligados à resistência a M. incognita raça 3.